La Recommandation générale n° 39 concrétise notamment les articles 1, 2, 7 et 14 de la Convention de l'ONU sur les droits des femmes. Le Comité demande la protection des femmes et des filles indigènes contre la discrimination intersectionnelle, la violence, la dégradation de l'environnement et l'expropriation. Les droits centraux concernent l'autodétermination, l'accès à l'éducation, à la santé, à la justice, à la participation politique, à la culture, à la terre, à l'eau et à l'environnement.